Matemática Pura e Aplicada (ver também o Programa de Pós-Graduação em Matemática)
- Álgebra
- Análise/Equações Derivadas Parciais
- Física Matemática
- Geometria Diferencial
- Matemática Computacional
- Probabilidade
- Sistema Dinâmicos
- Teoria Geométrica das Folheações
- Ensino e História de Matemática (ver também o Programa de Pós-Graduação em Ensino de Matemática)
Métodos Estatísticos (ver também o Programa de Pós-Graduação em Estatística)