No IM-UFRJ existem vários laboratórios que atendem a finalidades específicas:

• Laboratório de Métodos para Suporte à Tomada de Decisão (LAMDEC)
• Laboratório de Pós-Graduação em Estatística (LPGE)
• Laboratório de Sistemas Estocásticos (LSE)
• Laboratório de Matemática Aplicada (LABMA)
• Laboratório de Matemática Aplicada à Área de Petróleo (LabMAPetro)
• Laboratório de Análise Não-Linear (LAN)
• Laboratório de Pesquisa e Desenvolvimento em Ensino de Matemática e Ciências (LIMC)
• Laboratório de Tecnologias, Inclusão, Matemática e Educação