Matemática Pura e Aplicada (ver também o Programa de Pósgraduação em Matemática)

• Álgebra
• Análise/Equações Derivadas Parciais
• Física Matemática
• Geometria Diferencial
• Matemática Computacional
• Probabilidade
• Sistema Dinâmicos
• Teoria Geométrica das Folheações

• Ensino e História de Matemática (ver também o Programa de Pós-Graduação em Ensino de Matemáticade Pós-Graduação em Ensino de Matemática)

Métodos Estatísticos (ver também o Programa de Pós-Graduação em Estatística)

• Amostragem de População Finita
• Análise de Sobrevivência e Confiabilidade
• Econometria e Atuária
• Estatística Espacial e Modelos Espaço-Temporais
• Modelos Hierárquicos e Dinâmicos
• Probabilidade e Processos Estocásticos
• Teoria dos Valores Extremos

Ciência da Computação (ver também o Programa de Pós-Graduação em Informática)

• Algoritmos e Métodos Numéricos
• Modelos e Arquiteturas para Sistemas Inteligentes
• Redes de Computadores e Sistemas Distribuídos
• Sistemas de Informação
• Informática na Educação
• Gestão e Análise de Sistemas Complexos Gestão e Análise de Sistemas Complexos
• Sistemas Complexos Adaptativos Sistemas Complexos Adaptativos